8 marca – Poświęcenie nowego Ołtarza św. Jana Bożego
Wraz z przybyciem Zakonu Bonifratrów do Królewskiego Miasta Krakowa w 1609 roku szerzył się także kult założyciela Zakonu i wielkiego orędownika chorych i cierpiących, świętego Jana Bożego. Miało to miejsce zarówno w pierwszym konwencie- szpitalu pw. Św. Urszuli u zbiegu ulic św. Jana i św. Marka i było również kontynuowane po przeniesieniu konwentu i szpitala do po trynitarskiego kompleksu na krakowski Kazimierz w 1812 r. W otrzymanym Kościele Świętej Trójcy, bracia wraz z wiernym ludem Bożym czcili nie tylko swojego Patriarchę, ale także szerzyli kult znajdującego się w ołtarzu głównym Jezusa Nazareńskiego.
Pomimo burzliwych dziejów klasztoru i szpitala kult zarówno Jezusa Nazareńskiego jak i św. Jana Bożego nigdy nie ustawał. Staraniem władz Konwentu, 8 marca 2016r. ówczesny metropolita krakowski Stanisław kardynał Dziwisz ustanowił kościół klasztorny bonifratrów Diecezjalnym Sanktuarium św. Jana Bożego, patrona chorych. Wówczas zmieniono także wystrój kościoła, umieszczając obraz Jana Bożego w głównym ołtarzu, a figurę Jezusa Nazareńskiego na filarze bocznej nawy świątyni.
Po licznych głosach ze strony wiernych, wielu kapłanów, osób konsekrowanych, a także i samych braci, postanowiono ufundować św. Janowi Bożemu nowy ołtarz sąsiadujący z prezbiterium, i tym samym umieścić na nowo statuę Jezusa Nazareńskiego w ołtarzu głównym.
Po konsultacjach i zgodach Wojewódzkiego Małopolskiego Konserwatora Zabytków wykonano projekt ołtarza i rozpoczęto prace nad jego budową, które ostatecznie zakończono 7 marca br. Bryła nowego ołtarza wzorowana jest na ołtarzu maryjnym (ostatecznie podarowanym przez braci kościołowi parafialnemu w Czyżynach), który zakonnicy umieszczali dwa razy do roku (w maju i październiku), przed prezbiterium, na cześć Maryi, Matki naszego Pana i Patronki Zakonu Szpitalnego. Dokładnie w tym samym miejscu wybudowano nowy ołtarz, a nad obrazem świętego Jana Bożego umieszczono obraz Najświętszej Maryi Panny z Dzieciątkiem. Całość zwieńcza została złotą koroną z bordową draperią.
W sobotę, 8 marca w uroczystość św. Jana Bożego przy licznie zgromadzonych wiernych, z udziałem Ojca Prowincjała Franciszka Salezego Chmiela, kapłanów diecezjalnych i zakonnych Dekanatu Kraków-Kazimierz, osób konsekrowanych, braci przybyłych z sąsiednich konwentów, Ojciec Biskup Damian Muskus OFM, przewodniczył uroczystej Eucharystii i dokonał poświęcenia nowego ołtarza dedykowanego świętemu Ojcu Janowi Bożemu. W homilii, nawiązując do ewangelicznej przypowieści o Miłosiernym Samarytaninie, hierarcha przypomniał, że czasy się zmieniły, ale czas świętego Jana Bożego trwa nadal, i że wokół nas ciągle są ludzie o twarzach poranionego i porzuconego człowieka, którego ciągle wielu mija pozostawiając bez opieki i pomocy. Do wszystkich obecnych zwrócił się z pytaniem: „Jakim jesteśmy i jakim chcemy być Kościołem jako wspólnota? Czy Kościołem sztywnej litery prawa, czy Kościołem żywego słowa Ewangelii? Pasterz podziękował też dobrym braciom i ich współpracownikom za wierne kontynuowanie dziedzictwa św. Jana Bożego w prowadzonych przez Zakon dziełach.
Przez cały rok, co czwartek o godz. 18:00, w kościele-sanktuarium odprawiane są okolicznościowe nabożeństwa przez wstawiennictwo św. Jana Bożego, podczas których przedstawianych jest bardzo wiele próśb i podziękowań. Po nabożeństwie sprawowana jest Msza Święta w intencjach zbiorowych, a po niej adoracja Najświętszego Sakramentu do godz. 20:00. Świątynia, w której można modląc się podziwiać statuę Jezusa Nazareńskiego i nowy ołtarz, otwarta jest przez cały dzień.